O trabalho do Conselho Nacional é assessorado por cinco comissões e três assessorias que são responsáveis por tratar de assuntos que envolvam habilidades técnicas e/ou conhecimentos específicos. São elas:
Comissões:
Comissão de Formação – Maria Beatriz Spier Vargas
Comissão de Comunicação – Jersey Simon da Silva Ferreira
Comissão de Missão – Maristella Oliveira Teixeira
Comissão de Finanças – Sérgio Carlos Zavaris
Comissão de Eventos – Anabelly Medeiros Lopes e Daniele Aparecida de Almeida Correia
Assessorias:
Missões no Exterior – Katia Roldi Zavaris
Teológica – João Cláudio Rufino
Semeadores – Luiz César Martins e Rafael dos Santos Simões
Serviço
Grupo Profissionais do Reino – Cláudia Cunha